ซาโตชิ ได้พบกับโปเกมอนมายา โวลเคเนียน ซึ่งตกลงมาจากฟากฟ้า และมีพลังลึกลับบางอย่างที่ทำให้ทั้งคู่ตัวติดกัน โวลเคเนียนนั้นชิงชังมนุษย์ และพยายามทุกวิถีทางที่จะผละออกจากจากกัน แต่เหมือนพลังนี้ต้องการให้ ซาโตชิ ร่วมเป็นส่วนหนึ่งของภารกิจกู้ภัยนี้ ทั้งคู่มาถึงเมืองแห่งฟันเฟืองและเกียร์ ที่ซึ่ง รมต.ขี้ฉ่อได้ขโมยสุดยอดสิ่งประดิษฐ์ โปเกมอนจักรกล มาเกียนา ซึ่งถูกสร้างขึ้นตั้งแต่ 500 ปีก่อนมาเป็นของตน เขาวางแผนที่จะใช้พลังโบราณเพื่อยึดครองอาณาจักรจักรกล